El método, desarrollado por Bruce Merrifield (premio Nobel de Química de 1984), ancla el primer aminoácido a pequeñas partículas de resina. A partir de ahí se repite un ciclo: se retira el grupo protector del extremo libre, se acopla el siguiente aminoácido y se lava el exceso de reactivos. La química más usada hoy protege los grupos amino con Fmoc.
Al terminar la cadena, un tratamiento ácido —normalmente con ácido trifluoroacético (TFA)— separa el péptido de la resina y elimina los grupos protectores de las cadenas laterales. El producto crudo se purifica por HPLC preparativa y se liofiliza.
Cada ciclo tiene un rendimiento alto pero no perfecto. Si un acoplamiento falla en alguna molécula, esa cadena queda con un aminoácido de menos: son las secuencias de deleción, la impureza más típica de la síntesis y la razón de que la purificación sea imprescindible.
El origen sintético explica qué impurezas buscar (deleciones, truncados, restos de grupos protectores) y por qué casi todos los péptidos llegan como sal de TFA o de acetato. El certificado de análisis resume cuánto de todo eso quedó fuera.
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