Los péptidos tienen grupos cargados —el extremo N-terminal y cadenas laterales como las de lisina o arginina—. Para que el material sea estable y sólido, esas cargas quedan neutralizadas por iones de carga contraria. El péptido se obtiene así como una sal.
El TFA aparece porque se usa en la síntesis en fase sólida para liberar el péptido de la resina y en la purificación por HPLC. Por eso, si no se hace un paso adicional, el péptido queda como sal de TFA. Mediante intercambio iónico puede convertirse en sal de acetato o de clorhidrato, algo habitual en los péptidos de uso farmacéutico.
El contraión aporta peso sin ser péptido, así que reduce el contenido peptídico del polvo. En algunos ensayos celulares sensibles, además, el TFA residual puede interferir con los resultados.
Dos lotes del mismo péptido, uno como TFA y otro como acetato, tienen distinto peso molecular de sal y distinto contenido peptídico. El certificado debería indicar en qué forma se entrega.
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