Muchas hormonas peptídicas naturales terminan en amida, no en ácido: el organismo las amida en la última etapa de su maduración. Esa modificación elimina la carga negativa del extremo y cambia cómo la molécula encaja en su receptor.
En péptidos sintéticos la amidación se usa con dos fines: reproducir fielmente la hormona natural cuando esta es amidada, y aumentar la resistencia frente a las carboxipeptidasas, enzimas que degradan las cadenas desde su extremo C-terminal.
En una ficha técnica se reconoce por el sufijo –NH₂ (por ejemplo, D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH₂ en el SS-31). La amidación cambia la fórmula molecular y resta aproximadamente 1 Da al peso frente a la forma ácida, una diferencia que la espectrometría de masas debe detectar.
Una versión amidada y una sin amidar del mismo péptido no son intercambiables: difieren en masa, carga y, a menudo, en actividad. El análisis de identidad debe corresponder a la forma declarada.
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